I essayet „Fornuft og mysterium“ fra Kritik af den negative opbyggelighed, skriver Søren Ulrik Thomsen, at troen ikke retter sig mod det, vi ikke ved, men mod dét vi umuligt kan vide.

Søren Ulrik Thomsen skriver: „Vi skal uophørligt arbejde på at udvide den medicinske videnskabs rækkevidde, og så i øvrigt kaste vore bekymringer på Gud.“ Mange mennesker vender sig mod kirken, når livet er svært. Hvis de selv eller deres kære bliver alvorligt syge og de ikke ved, hvad de skal stille op. Den videnskabelige metode slår ikke til, når man er i krise og dybt fortvivlet

Videnskab og tro repræsenterer to verdener, der helt konkret eksisterer side om side. Thomsen udtrykker det sådan her: „Jeg tror på himmelen, og jeg tror på jorden, men ikke på alt mellem himmel og jord